日前,林木遗传选育国家重点实验室科研人员在植物生物学领域的国际权威期刊Plant Cell杂志上在线公开发表为题“杨树木材构成的mRNA因子和染色质融合的多层级调控网络”(Hierarchical Transcription-Factor and Chromatin Binding Network for Wood Formation in Populus trichocarpa,doi:10.1105/tpc.18.00620)文章,为提升森林生产力获取了一条崭新且准确的遗传改进途径,该论文被Plant Cell杂志列为周最热门的前5篇论文之一。林木遗传选育国家重点实验室姜立泉研究组和李伟研究组合作,利用毛果杨木质部原生质体系统(Linet al., 2014, Nature Protocols),统合mRNA组学和染色质分析数据,建构了以关键mRNA因子PtrSND1-B1细胞内的木材构成mRNA调控网络(Transcriptional Regulatory Network, TRN)。该调控网络还包括四个层级,具备定量调控特性的TF-DNA互作包含了一个特异性调控关系,即mRNA因子的调控如何通过这些互作被转导,从而转录借以木材构成的细胞壁基因(也称之为木材构成的效应基因)。研究找到,PtrSND1-B1细胞内了57个特异的TF-DNA必要互作,研究人员在30种基因型的转基因毛果杨中对这57种必要互作中的42种展开体内检测,其中大约有90%的互作皆在体内发挥作用,指出该TRN具备十分低的准确性。
同时,TRN说明了了不存在于有所不同mRNA因子中的联合调控靶点,进而找到了9种新的TF蛋白复合物(蛋白二聚体和三聚体),这些复合物参予调节特定类型木质素的生物合成。通过对mRNA因子PtrSND1-B1细胞内的mRNA调控网络研究,说明了了木材构成的过程有可能牵涉到到一种调控稳态,这种体内的调控稳态则由TF-DNA互作调控和TF-TF(蛋白-蛋白)互作调控的人组联合要求。
林木遗传选育国家重点实验室博士研究生陈昊和王鹏宇副教授为该论文的联合第一作者,姜立泉教授和李伟教授为该论文的联合通讯作者,另外9位林木遗传选育国家重点实验室的成员也参予了该项研究工作。该研究是由国家自然科学基金委、国家博士后科研基金、中组部青年千人计划、教育部高等学校学科创意引智计划(“111”计划)和林木遗传选育国家重点实验室创意项目等项目资助。
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